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01. 分子动力学模拟 分子动力学模拟(Molecular Dynamics, MD)作为研究分子体系结构与性质的第三种科学研究方法,已经在化学化工、材料科学与工程、物理、生物医药等领域发挥着越来越重要的作用。这种模拟方法不仅可以得到原子的运动轨迹,还可以观察到原子运动过程中的各种微观细节,为研究者提供了动态的研究方法和丰富的分析手段。 分子动力学模拟在生物大分子的运动与生物功能、蛋白-小分子之间相互作用机理、纳米材料分子的自组装过程
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1现阶段的CPU都集成了PCIe控制器,但主板上也有单独的PCIe控制器,只有确定故障PCIe设备的控制权属于CPU才可以使用下述解决方案。 PCIe设备不能识别的解决方案 1、把本机可正常运行的PCIe设备或者确定状况良好的PCIe备件更换到报错PCIe设备的位置; 2、如果能够识别,PCIe设备本身故障,更换之; 3、如果仍旧不能识别,可把两个CPU的位置调换一下(在此之前要确定是哪个CPU控制此PCIe设备): ① 如果故障位置跟着CPU转移,那么确定是此CPU故障; ② 如
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0要运行基本的分子动力学计算,请执行以下步骤: · 选择包含足够大的超级电池的POSCAR 。 · 如果执行连续运行,则将CONTCAR复制到POSCAR或可能在POSCAR文件中提供初始速度。它们是在 Wycoff 立场之后的一个单独段落中写成的。如果没有提供初始速度,则在计算开始时假定为随机速度。这完全没问题,但用户应该知道,由于初始随机速度,从不同计算获得的轨迹很难比较。 · 设置主要INCAR标签: o IBRION =0:通过将IBRION标签设置为 0启用分子动力学计算。 o P
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