非模式生物如小麦，无org.db，如何用clusterprofiler对其差异基因做kegg富集分析

哪位大佬会通过Xshell使用prokka，目前遇到问题了，求助求助呀

本科双非生物信息学在读学生各位大佬能分享一下推荐考研方向和院校 和经历之类的吗求求了

擅长单细胞数据分析 10X单细胞联合蛋白组分析 空间转录组数据分析 代谢组 蛋白组分析等等scRNAseq/空间转录组测序数据上游分析1.单细胞数据上游分析，cellranger，fastq生成表达矩阵，loupe文件可利用10x软件分析2.RNAseq上游分析，比对生成counts，tpm，fpkm3.空间转录组数据fastq生成矩阵反卷积对空转数据细胞注释空间marker基因位置展示空间发育轨迹分析空间CNV分析及区域划分空间区域打分及差异分析空间细胞通讯分析......单细胞测序分析，GEO/TCGA数据库分析

本人高二，省前三高中重点班，应该能上985。学校上生物课，被生物的精密所震撼，想学生物学，但听说是天坑。发现有生物信息学，听起来和计算机有关，应该不会那么坑，想问问这个专业发展就业前景怎么样？

外行，只是做了一下自己的检测。

吧友里的大佬们，跟大家请教一个问题哇:我的一个基因(CDS序列）在人家的一个RNA转录组原始数据里Blast结果是这样的是说明什么问题啊？这个基因就中间这点儿表达了嘛？

用tbtools简化基因ID，结果像这样，怎么办？（图1是未简化的，图2是简化了的）求求救救孩子吧

各位大佬，我从GEO数据库上获得一个数据集，但是这个数据集中不是标准的基因sample，是ENSEMBL，我想着用clusterProfiler包进行转换，ENSEMBL带有小数点，小数点后面跟着版本信息，我把版本信息删除后，确实可以转化成功，但是就出现了重复的ENSEMBL，我想请问各位大佬，现在这情况是需要把重复的给删掉，还是说将重复的取均值统一，还是说其他的什么方法呢？

有无遗传结构分析的大佬，可以帮帮小弟吗，有偿，做D统计，F4统计，alder祖先成分分析

KEGG富集的通路有些是那种特别大的一张图，里面还分了许多个小通路。已知某个差异基因，怎么找它具体在哪个通路里面？同时怎么看它的表达情况，上调or下调？ 哪位大佬能帮忙看看，困扰太久了（感谢）

调文件夹，重装都没用，咋整

先用TIMER对gene进行泛癌差异分析，绘制箱线图。 然后我又自己用R语言，TCGA联合Gtex分析。在TIMER中，Tumor高表达gene，但联合gtex后就变成tumor低表达gene了。比如：TIMER分析中，FOX3在GBM中，tumor表达量大于normal。但是用R分析就变成normal大于tumor了。是因为gtex联合，normal样本量增加导致的吗？

现在挺想走考公这条路，知道岗位很少，我还该坚持吗。考公上岸的几率大不大呢

有偿求用于聚类划定空间域的空间多组学数据集，一定要有金标准！价格可谈🙏🏻

各位大佬好 我目前在一所本科学校读生物信息学。本来刚入学的打算是就着生物这一个方向一直读研究生。 可是我现在大三 发现自己大学课程的生物成绩平平无奇。 虽然说没有挂过科 但也是处于B或者B-的等级，学过的课程第二年也大多数没有什么印象。但是生信专业学习的代码课程还是有点基础，请问我这种情况研究生还适合学习生物吗？很迷茫 求解答！谢谢各位

这几天用vina分子对接，然后有好多问题上网搜也搜不明白，有无佬救救 1.为什么有些结果出来是0啊，步骤都一样的2.为什么同一步骤隔了几天再做同一个对接出来的结果差异好大，之前做出了一个-6的，今天又做变成-4了，好像就是位置坐标不一样，但是每次在弄盒子的时候不应该重新搞盒子的位置吗？所以坐标会变应该正常吧3.在show interaction的位置一直报错，查了应该不是虚拟内存的问题，跟python版本有关？附图图1是问题3，图2是问题1，感谢大佬们

想问一下大佬们就业主要看专业实力还是学校啊。现在纠结去考985高校的生物信息学硕士还是华中农业大学的生物信息学的硕士

有没有大佬推荐一下考研院校或者给出一些就业建议，可以有偿

大佬们救命我从NCBI下载的单细胞测序数据包，创建参考序列和注释文件运行cellranger count指令后生成了barcode文件，但是我用barcodes去提取原始reads却无法提出，我查看测序数据包的结构发现原始reads没有带barcodes，这是为什么，我该怎么解决。求求了

小白怎么学习16s中V3-V4区域

请教吧内各位大佬，小弟在使用MaxQuant软件出了点问题。MaxQuant软件输出的protein group文件为什么没有gene name 和protein name列信息啊？请问各位怎么解决呢？

因新增合作项目需要，代为招聘以下相关专业工作人员。应聘人员请将详细简历及代表性业绩，发送至邮箱fhfxsh2024@hotmail.com。学历合格试用期表现优异者可申请入编省属事业单位。 生物信息学与人工智能研究员： （1）生物信息学或计算生物学相关专业，硕士研究生以上学历（含应届生）。 （2）熟练掌握本专业基本理论和实验方法，具备大数据云计算和人工智能编程开发经验。 （3）已在相关领域发表1篇（含）以上第一作者SCI科研论文（含已接收）

有没有代谢一下生信作业的

本人大三211地信在读 可以保研到国科大这种 但是对本专业无感 因为高中的时候特别喜欢生物 考虑跨保/跨考到生信 吧友们有没有什么建议 因为感觉地信和生信就业好像差不多 不如挑一个自己喜欢的

私信联系

请问可以通过分子对接方法寻找药物与蛋白受体的共同配体吗？

关键词：液体活检；基因检测；变异检测； 文献简介 标题（英文）：Clinical validation of a next-generation sequencing-based multi-cancer early detection “liquid biopsy” blood test in over 1,000 dogs using an independent testing set: The CANcer Detection in Dogs (CANDiD) study 标题（中文）：犬类癌症检测（CANDiD）研究：使用独立测试集对1000多只犬进行基于高通量测序的多癌种早期检测"液体活检"血液测试的临床验证 发表期刊：PLOS ONE 作者单位：圣地亚哥兽医专科医院等 发表年份：2022

本生信小白需要在metabolights或metabolomics workbench上下载mzML,mzXML或mzData格式的数据用作非靶向代谢组数据分析，这些格式的数据到底在哪里啊，我真的找不到啊

用原核生物比较基因组圈图工具BRIG软件，在运行BRIG软件时提示 Error: mdb_env_open: 磁盘空间不足。是怎么回事？电脑其实空间挺足的 感觉不是内存容量不足的问题 有遇到类似的可以解答一下吗？

吧友们，小登我是大一的生物科学专业，对生物信息学很感兴趣，知道它是生物学和计算机学交叉的一门专业，想提前学一点这个东西，以后考研考生物信息学，有没有人可以给我点指导什么的？✍谢大家

亲们，请问在excel里的基因序列要怎么用bioedit打开啊，试了好多次都打不开。我只会用bioedit打开fasta文件

文献简介 标题（英文）：The Impact of ACEs on BMI: An Investigation of the Genotype-Environment Effects of BMI 标题（中文）：ACEs对BMI的影响：探究BMI的基因型-环境效应 发表期刊：Behavior Genetics 作者单位：美国俄勒冈州立大学心理学系 发表年份：2022 文章地址：https://doi.org/10.3389/fgene.2022.816660 长期以来，研究表明童年创伤和逆境与成人负面健康结果之间存在显著关联。这些被称为“童年不良经历或事件”（ACE），包括18岁前儿童所经历的创伤性事件和不安全环境，如虐

各位学长姐们好，苯人是某985生信学院学生，现在是本科三年级。计划直博在本校继续读生信。想问问各位前辈，应该从哪些方面着手提升自己的能力。 还有就是有点想读博的时候找机会出国看看（交换，或者联培……都行），有没有什么建议，蟹蟹大家！！

有不少同学在学习过程中遇到网络爬虫一词都是一头雾水。那到底啥是网络爬虫呢？今天大表哥就给大家介绍网络爬虫技术！——什么是爬虫：一种自动获取网络页面内容的程序网络爬虫也叫作网络机器人、网络蜘蛛是一种按照一定规则，自动地抓取网络信息的程序或脚本通用爬虫搜索引擎的爬虫系统追求大的爬行覆盖范围聚焦爬虫针对某种内容爬虫只对特定的网站进行爬取——爬虫的一般流程：Step1-获取网页内容：给一个网址发送请求，该网址会返

变量变量类型运行shell时，会同时存在三种变量：局部变量：局部变量在脚本或命令中定义，仅在当前shell实例中有效，其他shell启动的程序不能访问局部变量。环境变量：所有的程序，包括shell启动的程序，都能访问环境变量，有些程序需要环境变量来保证其正常运行。必要的时候shell脚本也可以定义环境变量。shell变量：shell变量是由shell程序设置的特殊变量。shell变量中有一部分是环境变量，有一部分是局部变量，这些变量保证了shell的正常运行。

例如反应hom__L_c + nadp_c <=> aspsa_c + h_c + nadph_c，去掉流通代谢物后转化为反应的SMILES表示形式[lbk]NH3+[rbk][lbk]C@@H[rbk](CCO)C(=O)[lbk]O-[rbk]>>[lbk]NH3+[rbk][lbk]C@@H[rbk](CC=O)C(=O)[lbk]O-[rbk] 请实现（1）利用代码实现，给反应的SMILES形式添加原子映射信息，变为[lbk]NH3+:0[rbk][lbk]C@@H:1[rbk]([lbk]CH2:2[rbk][lbk]CH2:3[rbk][lbk]OH:4[rbk])[lbk]C:5[rbk](=[lbk]O:6[rbk])[lbk]O-:7[rbk]>>[lbk]NH3+:0[rbk][lbk]C@@H:1[rbk]([lbk]CH2:2[rbk][lbk]CH:3[rbk]=[lbk]O:4[rbk])[lbk]C:5[rbk](=[lbk]O:6[rbk])[lbk]O-:7[rbk]（2）利用Rdchiral

有没有大佬指点一下，为什么调整一个因素的形状颜色会导致所有node的形状颜色发生改变。sos 有没有什么解决办法或者是参考资料可以找找，谢谢大佬，好人一生平安，祝顺利毕业，文章顺利，一切顺利！

有没有大佬知道这个图咋看呀？是一个数据库介绍的文件里的图

用fastqc打开fastqc.gz卡住不动，解压了之后命令行也显示null，这该怎么办呀👀

已经获得PC1和PC2数据，怎么绘制好看的PCA图啊，什么都不懂老师让分析和绘制转录组数据

这个专业电脑什么配置能满足专业需求啊

r语言数据分析：t检验，方差检验，相关性，pca等降维算法，机器学习。 r语言各种绘图：箱形图，云雨图，矩阵，网络图

救命，有人会mirna靶基因预测吗，真的搞不懂啊物种是昆虫，目前有mirna的序列以及物种的基因序列，老师说要做匹配，有没有人能帮帮忙

有没有大佬指点一下circexplorer2的安装，自己搞了几天都没弄好需要帮助

985cs本，生信硕士的就业薪资水平大概是个什么级别

请问为什么会出现这种情况，应该如何继续使用啊？

求大佬帮忙做张LD单倍型图，有偿，私聊就可以了！！！