东江源区的三个县级行政区中，安远县、寻乌县是国家扶贫开发工作重点县，定南县是省级贫困县，居民收入水平普遍较低，近半数人口属于贫困人口，2009年东江源区人均生产总值约10509元，与2009年中国人均国内生产总值25575元相比，差距较大。2009年三个县农民人均年纯收入平均为2936元，仅为江西省农民人均纯收入的58%，为广东省农民人均纯收入的42.5%。产业发展方面，与现代化水平相比，第一、第二产业的比例还处于高位，第三产业发展远远落后于发达地区。