在她的婚姻问题上，起初比利时王室希望王位继承人阿尔伯特（即后来的阿尔伯特一世）娶这位奥地利女大公，但这个提议随即遭到了当时的比利时国王利奥波德二世的反对，说起来，伊丽莎白还是他的外孙女呢（鲁多夫王储的妻子史蒂芬妮是利奥波德的女儿），但这位老国王当时正气愤史蒂芬妮嫁给了一位与之身份不对等的伯爵，觉得让这样一个人（伊丽莎白）成为未来比利时王后是耻辱。此外，也有人顾虑伊丽莎白的身世（他的父亲甚至祖母。。），觉得她的性格可能不稳定，难以担当王储妃大任。
后来阿尔伯特娶的是伊丽莎白的表亲，茜茜公主弟弟karl Theodore的女儿，来自巴伐利亚的伊丽莎白公主。
事实证明比利时的顾虑是对的，我们这位来自奥地利的伊丽莎白女大公性格的确没有来自巴伐利亚的伊丽莎白公主稳定。 后者和阿尔伯特的婚姻非常美满成功。


对于嫁给什么人，伊丽莎白有自己的主张。她在一次社交场合上碰到了心仪的人，Prince Otto Weriand von Windisch-Grätz，尽管对方身份低于自己，比自己大十岁，而且这甚至是伊丽莎白一厢情愿的，因为otto已经订婚。
于是伊丽莎白请求祖父同意这门婚事，弗兰茨二话没说同意了，找来了otto，让他解除之前的婚约，和伊丽莎白订婚了。当时otto那叫一个惊讶呀，当然，最后也同意了。


于是，两人就订婚了。
伊丽莎白放弃了自己的继承权，得到了丰厚的嫁妆。

但是一系列的丑闻夹杂在两人的婚姻中，显然这桩婚姻谈不上幸福。
结婚一年之后，两人就在布拉格因为一位女演员争吵，伊丽莎白还对这位女演员开了枪，导致了后者的死亡。这是震惊维也纳的丑闻，为此年迈的弗兰茨没有参加孙女孩子的受洗。

伊丽莎白和母亲史蒂芬妮

两人结婚纪念照。

两人有四个孩子
Prince Franz Joseph (1904–1981)
Prince Ernst (1905–1952)
Prince Rudolph (1907–1939)
Princess Stephanie of Windisch-Graetz (1909–2005)
其中大儿子的名字是向弗兰茨致敬，小儿子纪念自己的父亲鲁多夫王储，唯一的女儿则是向母亲史蒂芬妮致敬。

四个孩子也不能联系两人的感情，伊丽莎白和otto都各自有婚外情。。

伊丽莎白和小女儿史蒂芬妮。

伊丽莎白和儿子。

三个儿子

虽然和丈夫早就貌合神离，但两人还是一直坚持到弗兰茨皇帝去世后才正式离婚。

伊丽莎白和Leopold Petznek1948年结婚。Leopold Petznek 1956年去世。

伊丽莎白1963年去世，死前留下遗嘱，她手上的哈布斯堡家族的祖传遗物全部赠予政府。