第一，行业化程度不深，商品不够标准化。B2B平台要实现交易，首先面临的是平台的行业化和商品的标准化问题，而目前B2B网站的行业细分程度明显不够。商品的描述应该更加精准，更符合行业特征，搜索引擎也应该是符合行业化商品特征的专业搜索引擎。在这网络盛行的时代，内容营销已经走入了B2B的殿堂，这对于了解到行业文化程度非常重要。
第二，B2B交易流程复杂，诚信问题难解决。与B2C相比，B2B的交易流程更加复杂，很多环节能以通过线上完成;而由于单笔交易涉及的金额大，如何解决采购商的信任也是一大难题。交易逃不掉的就是安全性问题，以及交易双方的诚信问题。
第三,用户习惯难改变，配套服务跟不上。B2B平台首先要尊重用户原有的交易习惯和方式，多学习线下交易的规则和流程，然后再尝试引导他们走更便捷的路径，如线上交易。目前而言，B2B平台改变它们的使用习惯很不容易。