葡萄糖氧化酶提升畜禽性能的作用主要是通过消耗氧自由基保持肠道健康，产酸促进肠道益生菌定殖、促进内源酶活性，产生过氧化氢消除霉菌毒素。详细机理如下：
（一）消除氧自由基，保持肠道上皮细胞的完整，抑制球虫和病原菌的入侵 。
在正常情况下，体内抗氧化防御体系会清除机体产生的自由基，保护组织细胞免受损伤，但当机体处于应激状态时，机体产生过多的自由基会引起肠黏膜通透性增加，肠道组织受损，进而诱发肠黏膜脱落、溃疡甚至炎症反应，破坏肠道上皮细胞的完整；（引自:赵文 《氧自由基与肠道损伤》,河南医学研究,1994,3(3)） 葡萄糖氧化酶具有抗氧化作用，能清除机体肠道代谢产生的自由基，保护肠道组织免于自由基的氧化损伤，从而保护肠道上皮细胞完整，降低球虫及病原菌侵入肠道上皮寄生部位的机会，达到防御球虫、病原菌入侵的目的。
（二）改善胃肠道酸性环境，促进营养物质消化吸收
1. 催化葡萄糖生成葡萄糖酸，在肠道内发挥酸化剂的作用，创造酸性环境；降低胃中的pH值，激活胃蛋白酶，促进营养物质的消化吸收；
2. 能改善饲料的采食，在动物出现拒食、厌食、消化不良、腹泻时，添加葡萄糖氧化酶可以使动物迅速恢复正常采食。
（三）消除肠道病原菌生存环境，保持肠道菌群平衡。 葡萄糖氧化酶作用过程消耗氧气，产生葡萄糖酸可以创造酸性缺氧的环境，利于乳酸菌、双歧杆菌等有益菌群的占位，破坏大肠杆菌、沙门氏菌、巴氏杆菌等有害菌的定殖。
（四）解除霉菌毒素中毒
1. 葡萄糖氧化酶可抑制黄曲霉、黑根霉、青霉等多种霉菌，对黄曲霉毒素B中毒症有很好的预防效果；
2. 葡萄糖氧化酶作用生成一定量的过氧化氢，使如黄曲霉毒素这种具备氧杂萘邻酮基团的霉菌毒素被氧化脱氢，分子结构发生改变，解除毒性。或通过氧化作用破坏呋喃环结构，使环打开，毒性消失，从而达到脱毒的作用；(引自：冯定远,左建军 著《饲料酶制剂的应用技术体系》,31-25)
3. 当 GOD进入动物消化道后，一部分会进入肝脏，加速肝脏 内的氧化还原反应，从而加速毒性成分的代谢，畜禽霉菌毒素中毒得以解除。（引自：赵晓芳,张宏福.葡萄糖氧化酶的功能及在畜牧业中的应用[J]. 广东饲料,2007,16(1):34-35. 杨久仙,曹靖.葡萄糖氧化酶的应用进展[J].山西农业大学学报,2013,33(1):88-92.）