一、舊校舍火災事件


火災發生的原因究竟為何？姑且不論，但是真正該注意的，是為何真正原因，以及「火災本身」會被發現，又可從以下三點探討：
1. 飛鳥在當時應該已經被消除能力了，即使她仍然保有能力，實在難以想像以透明人能力能查到這種情報。猿島既然知道自己會被栽贓成縱火犯，就不可能對任何人訴說(山田除外)，因此飛鳥理論上是不可能知道的。魯迅曾批評羅貫中的三國演義是「欲顯劉備之長厚而似偽，壯諸葛之多智而近妖。」作者刻意渲染飛鳥在各方面都很完美，卻反而失真，也是一樣的狀況。
2. 山崎雖然是觀測手，但是他頂多只擁有第7個魔女的部分能力，而沒有一般魔女的能力，他頂多只能透過里香來得知那些學生中了能力，而不能預知未來，所以也不可能知道。
3. 毫不相關的諾亞也會提高警戒，這更沒有道理。

二、飛鳥的職務
從很多地方可以得知，飛鳥的職務是「秘書」。



有特定章節顯示飛鳥是「會長助理」，但是將其視為與「秘書」同義，當無疑義。

然而也有特定章節顯示飛鳥是「副會長」，這明顯有矛盾。

三、玉木的職務
玉木理論上是「副會長」才對，否則他不可能有資格角逐學生會長寶座。雖然朱雀高中學生會長有絕對權力，可以指名任何人成為下任會長，但是也不可能隨便挑選。而且宮村也說過，學生會的傳統是會長會從副會長中挑選適合人選成為下任會長。

但是這張圖卻沒有顯示玉木的名字與職務，明顯有問題。

四、新魔女的誕生與發現
在第一次儀式之後，里香被消除了能力，山崎也失去了觀測手的身分，兩人已經成為普通人，這種情況下，除非是新魔女明顯使用能力，否則是不可能在短時間內察覺新魔女誕生並發現新魔女的。

五、潮發現自己有奪取能力
只有第7個魔女與觀測手能發現魔女殺手，可是即使是詫摩也不太可能會主動告知潮。除非他認為很有趣，不然詫摩是不會多管閒事的。當然，也無法想像被消除能力的飛鳥能夠察覺潮的能力。

六、南希受姬川之託消除記憶

根據本作劇情，南希是透過儀式消除所有人的記憶的。
透過儀式可以消除記憶，這是沒有疑問的，但是過程與結果則不無矛盾，茲列舉如下：
1. 祭壇之間的使用過程
要舉行儀式，就必須使用祭壇之間。如果在任何地方都能舉行儀式，那將棋社也就沒有理由要大費周章，發動罷免學生會的運動，又企圖在改選中勝選來取得祭壇之間的使用權。純粹聚集七個魔女，遠比取得特定房間的使用權來得簡單。南希如何能使用祭壇之間就充滿疑問。因為南希基於自己第7個魔女的身分，是不可能與任何人有深交的，更不用說是和學生會成員有所往來。這樣還能使用祭壇之間，實屬荒謬。
2. 許願人的身分
要說明這個問題之前，先整理本作出現的三次儀式相關資料：
(1)第一次儀式
參與魔女：
白石麗
小田切寧寧
大塚芽子
猿島馬莉亞
瀧川諾亞
飛鳥美琴
西園寺里香
許願人：
山田龍
願望：
消除魔女的能力。
(2)第二次儀式
參與魔女：
紺野翼
萌黃小鳥
筑紫愛子
清集院桃子
菊池茜
姬川空
南希(虹野晴子)
許願人：
山田龍
願望：
取回自己的記憶。
(3)第三次儀式
參與魔女：
黑崎仁
一條政宗
三浦悠理
鈴原光
艾力克斯˙史賓賽
山田龍(代替黑詫摩)
詫摩類
許願人：
玉木真一
願望：
恢復所有人的記憶。
由以上資料可知，舉行儀式必定要有「七個魔女」以及「一個許願人」，而且每次儀式中，許願人都「不是」參與儀式的魔女。這裡衍生出一個問題：參與儀式的魔女可以是許願人嗎？
如果參與儀式的魔女可以是許願人，就會有矛盾，因為在儀式舉行的過程中，除了第7個魔女之外，其他魔女的時間都會停止，這樣是不可能執行許願動作的，因此姬川不可能是許願人。而且如果第7個魔女的吻是必要的，那麼南希也不可能是許願人，因為她不可能跟自己接吻。
如果參與儀式的魔女不能是許願人，一樣有矛盾，因為無法想像會有任何人會自己去許下這種願望，或是接受姬川的請求而代為許願。至少，山田早在當時就喜歡上小麗，根本沒有理由消除記憶。
3. 如果許下的願望是「消除所有人的記憶」，那南希應該也不會記得才對，可是她卻還記得有過這回事，明顯有矛盾。

七、第7個魔女的能力相連問題

山田先複製了南希的第7個魔女的能力，之後潮也奪取了南希的能力，換言之，兩人的能力來源是相同的，因此，會出現「能力相連」的情況，似乎合情合理。
但是這裡也有矛盾。
如果山田先從某個魔女身上複製了虜獲人心的能力，之後潮也奪取了該魔女的能力，那又會如何？
難道會因為潮使用了能力，被施加能力的對象在喜歡上潮的同時，也喜歡上山田嗎？這一樣是不合理的。
當然，要說是因為第7個魔女的能力很特殊，所以才會有例外，這還勉強說得通。但是這些細節沒有設定好，是作者的疏失。

八、黑詫摩打算利用山田舉行儀式

黑詫摩知道，以山田的複製能力，是可以讓山田代替魔女，進而舉行儀式的。到底黑詫摩是如何得知的，不無疑問。或許有人說，因為黑詫摩是天才，所以馬上就想到了，但是這樣解釋未免太過草率。因為一開始有提到，參加儀式的必須是魔女本人才行，而魔女殺手是不行的，這樣有前後矛盾的嫌疑。或許又有人說，因為山田的複製能力非常強，所以沒問題。一下子出現太多例外，很容易被人認為是「想到哪畫到哪」，這是漫畫家的大忌。

九、玉木的奪取能力消失

玉木為何會失去能力，姑且不論，但是他失去能力的時間點，以及他發現這件事情的經過，明顯有矛盾：
1. 從玉木在學生會選舉結束之後還記得山田等人這件事看來，可以合理推論他在這時還保有能力。然而，漫畫卻說能力早在第一次儀式過後就消失了，這裡就有矛盾，因為玉木要是在第一次儀式過後就失去能力，就不可能會記得山田等人。而第二次儀式也是在潮使用第7個魔女的能力之前舉行的，所以也不可能。
2. 南希在被消除能力之後，也被消除了記憶。她不可能還記得與魔女相關的事情，當然也就不可能知道玉木失去能力。

十、山田在畢業典禮恢復小麗的記憶

雖然這像是「王子親吻公主，破除了公主身上的魔咒」的老套橋段，感覺很浪漫，但是一樣有矛盾。因為在小麗離開朱雀高中之後，所有的魔女能力都消失了，而關於小麗的記憶也消失了，但是山田和潮不是魔女，而是「魔女殺手」，這裡所衍生的問題是：魔女殺手的能力是不是也一併消失了？
1. 如果魔女殺手的能力沒有一併消失，就會有矛盾。因為潮本身是魔女奪取者，而不是第7個魔女，就算第7個魔女的能力消失了，也還有魔女奪取者本身所有的「保持記憶的能力」，不可能只有山田記得才對。
2. 如果魔女殺手的能力確實一併消失，一樣有矛盾。因為那就代表連山田也變成普通人了。就算小麗的願望可以使山田還記得她，但是普通人和普通人接吻根本不可能發生任何事，所以也不可能因此而使小麗恢復記憶。
當然，要說是因為最初的魔女很特殊，所以就連願望也能造成特殊效果，這也勉強能解釋。但是感覺整個設定以及情節安排都漏洞百出，可見作者在這方面明顯沒有用心。

以上就是本人所發現的疑點與矛盾，歡迎各位討論。

能完結就已經很不錯了

我只想知道山田他究竟搞清楚他为何拥有复制的能力

我還是覺得山田魔女這漫畫在第一次儀式時大約前100話是最好看的, 後面魔女變男的, 虎頭蛇尾的一堆反派, 人物事件的刻劃明顯不如前面尋找七個魔女時的懸疑推理, 跟超研社的吐槽式友誼, 而且山田當年打架停學的事件前後一堆版本, 有些描述成記憶竄改, 最後記憶全部恢復時反而沒有甚麼描述, 估計又是作者想要趕快完結收尾不想再爛尾了.