差也差不多。。
真实系统和虚拟系统是分开的，至少系统本身是分开的。但是有部分共享数据存储在卡里，所以建议格机来做系统分离，让数据也不共通。
系统互不影响（上面说了，共有数据是会影响的，比如游戏摆的位置什么的。。）
虚拟系统就是在卡上做一个系统，在早期破解随着 真实系统的升级而失效 的时候虚拟系统变得非常重要，但是现在ab9（需要cfw保护）运行升级真实了，就不需要虚拟系统了。
目前看来虚拟系统真的就是自己认为需要用来保护主机的话使用一下，或者非ab9或者非luma固件的用一下。。