
工欲善其事 必先利其器
今天我们为你精选了
PYMOL
WIN版安装教程
附带安装包及教程
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教学软件介绍
PYMOL

PyMOL适用于创作高品质的小分子或是生物大分子(特别是蛋白质)的三维结构图像。软件的作者宣称,在所有正式发表的科学文献中的蛋白质结构图像中,有四分之一是使用PyMOL来制作。
PyMOL是少数可以用在结构生物学领域的开放源代码视觉化工具。
软件以Py+MOL命名:“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出来的,“MOL”表示它是用于显示分子(英文为molecule)结构的软件。
PYMOL介绍
1:界面
pymol界面分为菜单栏,命令行框,以及蛋白操作界面,蛋白展示界面。


内容:导入蛋白,并显示不同的形态。
DEMO:
(1)导入蛋白
a:直接命令行输入
fetch PDBid
b:从PDB下载蛋白文件,从菜单栏file导入
(2)展示蛋白不同形态
此为pymol可以进行蛋白展示的6种representation,

操作为:
pymol蛋白操作界面,点击字母S,出现的框中,出现上述representation

These make you look like a master of PyMOL.
DEMO:制作一个简单的蛋白旋转动画
制作一个类似的动画,对于清楚的展示你做要表达的内容十分重(la)要(feng)。
pymol的动画制作是一个比较繁琐的流程翁,此处教授一个简单的DEMO,方便入门。
流程:
Movie->Program->Camera->X-Roll->N Seconds
或者
Movie->Program->Camera->Y-Roll->N Seconds
导出流程:
File->Export Movie As -> MPEG->选择GIF->save movie as->输入文件名称
希望帮助到需要的小伙伴