水质自动监测系统仪表分析单元、取水单元、配水单元、控制系统、数据采集/处理/传输系统、防雷设备组成。其中仪表分析单元由五参数分析仪、COD分析仪、总磷分析仪、氨氮分析仪、总氮分析仪等组成； 采水系统将水样采集预处理后供各分析仪表供各分析仪使用；系统泵阀及辅助设备由PLC 控制系统统一进行控制；各仪表数据经 S232/485 接口由数采工控设备进行统一数据采集和处理，系统数据有线光纤或4G无线传输两种传输模式。
为防止雷击影响，水质自动监测系统配置完善的防直击雷和感应雷措施。系统配置智能环境监控单元对系统整体安全、消防和动力配电进行智能监控。