太阳系各天体长期稳定，主要是不稳定的天体已经消亡，余下的自然轨道比较稳定，我觉得有以下原因：
1、太阳个头比行星大很多，且太阳系附近没有大的恒星系干扰，太阳系各行星近似于运行在围绕太阳的二体系统；
2、各行星轨道偏心率均较小，轨道间间距较大，各行星间作用力不大，有利于轨道稳定；
3、二体系统的轨道能量与椭圆轨道的半长轴(l)成正比(注意，半长轴不是行星到太阳的距离，偏心率(α)大，则太阳离椭圆中心越远，近日点速度越快)，行星轨道在受到其它天体的力作用下，由于互相速度方位的不同，会产生加减速或高度的各种不同影响，导致不同结果：α减小而l即能量变大，α减小而l变小，α增大而l变大，α增大而l变小，并伴随或仅仅只是轨道的进动，行星轨道的稳定，要么是各种变化量太小，要么是各种变化量会负反馈稳定，其中水星的轨道能量变化和进动是未来不稳定因素之一。
4、轨道共振：一个多体轨道系统，各天体轨道周期必然是周期的或近周期的，由于互相影响及偏心率的原因，两行星距离随时间变化，若不存在明显的周期耦合，则最小公倍数周期时间将会很长，在这很长的时间内，两行星的相互作用均随时间各异，难保某段时间内，影响累加剧烈，导致轨道不可逆地产生大的变化甚至失控，尤其是内侧天体的远日点大于外侧天体的近日点时，甚至会发生相撞甚至落下太阳或飞离太阳系可能。以时间为旋转角度，以离太阳距离为极坐标，作图，可表示出随时间，两行星的距离Δr变化，理想的情况是Δr始终保持较远且周期变化。总结下来，就是两者的最小公倍数周期很小，所以两者轨道周期比为p/q不可再约，p和q均为较小的整数，pq乘积为最小公倍数周期。
5、轨道共振的存在也会使某些轨道天体被甩出，造成某些轨道空隙，因为两或三个较大天体形成轨道共振时，对其外的小天体的作用是周期重复的，由于不能兼顾周期性的作用抵消为零，累积后将使该小天体被甩出这个轨道。