清朝和准噶尔汗国的关系，就是中国数千年来中原王朝和游牧民族政权的关系。
清朝入主中原后就是中原王朝了。
清朝和准噶尔汗国的关系类似于：秦汉和匈奴、魏晋和鲜卑、北魏和柔然、北周和突厥、隋唐和突厥、唐朝和回鹘、唐朝和黠戛斯、北宋和契丹、金国和蒙古、明朝和鞑靼瓦剌，属于一种相互对立的关系。。

准噶尔汗国不是叛乱。说准噶尔汗国是叛乱的，那是满清王朝的污蔑，也是处于某些因素考虑。
准噶尔汗国是游牧民族政权，类似于匈奴、鲜卑、柔然、突厥。
准噶尔汗国由准噶尔部建立。准噶尔部是瓦剌（卫拉特，或叫厄鲁特）蒙古的一个分支。而瓦剌蒙古则是由北元分裂后而来的。瓦剌（卫拉特）一度俘虏大明天子明英宗。
可以说准噶尔汗国是瓦剌（卫拉特）汗国的继承者。

准噶尔汗国不是叛乱。说准噶尔汗国是叛乱的，那是满清王朝的污蔑，也是处于某些因素考虑。
准噶尔汗国是游牧民族政权，类似于匈奴、鲜卑、柔然、突厥。
准噶尔汗国由准噶尔部建立。准噶尔部是瓦剌（卫拉特，或叫厄鲁特）蒙古的一个分支。而瓦剌蒙古则是由北元分裂后而来的。瓦剌（卫拉特）一度俘虏大明天子明英宗。
可以说准噶尔汗国是瓦剌（卫拉特）汗国的继承者。

当年大明太祖洪武皇帝朱元璋灭元朝后，元朝残余势力逃往长城以北，并且继续以大元年号自立。大明成祖永乐皇帝朱棣年间，北元分裂成两大部分：鞑靼和瓦剌。其中鞑靼是北元的正统，鞑靼的统治者都是原北元皇室后裔。但是瓦剌则是旁支。
瓦剌在明英宗年间强大起来，并且俘虏了大明天子明英宗朱祁镇。随后日渐衰落。
大明末年，鞑靼分裂成两大部分：漠南和漠北。其中漠南蒙古就是察哈尔、科尔沁等部落，都位于今天内蒙古；而漠北蒙古则是喀尔喀，就是今天的外蒙古。此时瓦剌蒙古则是盘踞西部，被称为漠西蒙古。瓦剌（卫拉特）其实在明朝后期也发生了大分裂，分裂成四大部分：准噶尔部、和硕特部、土尔扈特部、杜尔伯特部。除此四大部外，还有很多小部落。分裂后的瓦剌统治方式也发生了改变，原来的瓦剌汗国，内部高度统一，是一个统一的汗国。但分裂成四大部后的瓦剌，以联盟的方式存在着，并且以各部落推举的方式来决定一位盟主。也就是说瓦剌（卫拉特）由原来的汗国，变成了联盟，就是“卫拉特联盟”。

瓦剌（卫拉特）联盟中，准噶尔部逐渐强大起来，并且吞并了杜尔伯特部和其他很多小部落，土尔扈特部因为不堪忍受准噶尔部的压迫而将整个部落西迁到欧洲伏尔加河。和硕特部则是南下征服了青藏高原。准噶尔部继承了原瓦剌（卫拉特）汗国的所有地盘，建立了准噶尔汗国，时年1642年。