成为新千禧年系列旗手的万能MS
这是作为下一期主力机而开发的泛用型MS，以代替此前开发的扎夫特主力MS——ZGMF-1017基恩和ZGMF-600盖茨。第一次联合PLANT大战后，扎夫特着手开发被称为新千禧年系列的新型MS群。本机就是其中具有代表性的机体。另外，机体名称ZAKU是取自“ZAFT Armored Keeper Of Unitty”的首字母而来。
当初原计划是核动力搭载机，不过，由于c.e.72年3月PLANT和联合签订了尤尼乌斯条约，核动力的搭载被搁置，重新设计为通常的电池驱动型，此时一部分武装和PS装甲等装备被省略了。另外，尤尼乌斯条约还限制了MS的保有数量，为了一架ms就能够应对各种各样的任务，新导入了Wizard系统。这是换装被称为Wizard的外置可选装备，是用1架MS就能对应各种的战况和战局的划时代系统。另外,此举还意在节省 ms 的开发成本。
另一方面，为了通过装备换装应对全局面，基础机的性能要求有高次元的平衡，但本机经过了应对尤尼乌斯条约的调整，仍是凌驾于联合军GAT系列规格之上的高性能机。在第二次联合PLANT大战中作为主力机继续活跃。

装备换装系统是被称为新千禧年系列的 ms 群中最大的特征。这与限制机体保有数的尤尼乌斯条约并不抵触，可以说是以MS为平台谋求多功能化的结果而产生的系统吧。代表性的wizard是烈焰型wizard和炮击型 wizard，不过，其中也有作为旧MS近代化改修的一环而开发的地狱犬wizard。而且由于系统规格外泄，因此还开发了扎夫特制造的正规品以外的wizard。究其源流的话可以追溯到联合军在GAT-X105 强袭中采用的强袭背包系统，不过比起本家，扎夫特貌似更热衷于开发。这个wizard系统的进一步发展后就是第二世代的ZGMF-X56S脉冲中采用的剪影系统。

如果炮击型 wizard群集中火线的话，可以期待与舰炮射击等同等的效果。根据战局能轻松更换装备也是其优点。

异形佣兵喜欢的异形wizard规格
作为战斗用调整者而制造的假面佣兵，SUO(中文死的意思。假名)的专用机。
装备了地狱犬wizard的扎古勇士。wizard系统本身是新千禧年系列中导入的装备换装系统。地狱犬wizard是为了延长兵器运用寿命而开发的，装备在正处于旧式化的巴库上，以提高近接戦闘能力等等。
当然，由于规格相同，ZGMF-1000也可以装备。搭乘者死之所以选择这个特殊装备是因为他喜欢格斗战。死的战斗风格是用具有灵活构造的光束獠牙系统的“头部”和机体双臂握住的光束军刀组合成四刀流。
原本认为四足兽形态的MS Tmf/a-802能够更稳定地运用，但也许是因为搭乘者的技术高，发挥了很高的战斗力。在战场上，击破了由奥布的“拳神”巴里·何操纵的MWF-JG73民用异端JG定制型（MS的性能差也很大）。令在场的前扎夫特王牌机师、以“猛兽”著称的卢卡斯战栗不已。但是，在和拳神的弟子特洛伊·诺瓦雷驾驶的MBF-P04绿异端交战中败北。
这是死的雇主民间军事公司（PMC）筹措的机体（入手渠道等不明）。外表是ZGMF-1000扎古勇士，但进行了超过ZGMF-1001扎古幻影的调整。机体的颜色以黑色为基调，加入了红色。并且，在左肩的装甲处部绘有特征性的徽章。

指挥密涅瓦队的白色扎古幻影
ZGMF-1001扎古幻影是ZGMF-1000扎古勇士的改修机，相当于上位机种。主要是C4ISR=指挥、統制、通信、计算、情报、监视、侦察的各能力得到了强化，可以说是面向指挥官和部队队长级的机体。与ZGMF-1000外观上的不同之处在于，头部追加了刃状天线，在两肩部安装对光束盾的例子很多。
密涅瓦队的雷作为ZGMF-1001/M烈焰型扎古幻影的机师而闻名，使用的烈焰型Wizard是以提高在宇宙空间的机动性为主要目的的Wizard。装备大型推进器单元和AGM138“火蜂”诱导导弹。但是在地球的重力下（大气层内）也能发挥一定的效果，不过由于不是能够获得升力的结构，所以无法自由飞行（跳跃这种程度是可以的）。因此，要进行空战需要古鲁等支援机械。
因为地球联合军和奥布有不少空战用的机动战士，因此在实际交战中被迫陷入苦战的情况也有。在克里特岛海域的战斗中，本机与母舰密涅瓦一起受到了严重的损伤。
另外，此战之后，搭乘者雷被迪兰达尔任命为特务队FAITH，从本机换乘为ZGMF-X666S传说。

玖尔队所属迪亚卡的专用机。以前搭乘的是ZGMF-1000/A1炮击型扎古勇士。
尽管表面上他一度从扎夫特退伍，但毕竟是原王牌(红衣)，所以即使被赋予高性能的上位机种也不奇怪吧。只是本机被认为是迪亚卡私人筹措到的机体(以个人为单位也能得到MS，令人惊讶)。
机体上有以他的个人颜色深灰色为基调的着色，装备的Wizard不是之前爱用的炮击型Wizard，而是重视机动性的烈焰型Wizard。
这是因为到了大战后半期，所属的玖尔队内还有其他装备了炮击型Wizard的机体，这被认为是由于他作为队长伊扎克的心腹所以在战场上担任指挥职务的机会增多。

伊扎克的专用机在指挥官用的ZGMF-1001扎古幻影中装备了斩击型Wizard。型号为ZGMF-1001/K，机身颜色涂上了伊扎克的个人颜色——蓝色系。
武装方面，是以MMI-M826九头蛇加特林光束炮和MA-MR“镰刀”G7光束斧作为主兵装的近接战斗型。除此之外，也可以使用原来的标准装备MMI-M633光束突击枪。
伊扎克在使用扎古时选择了格斗战优秀的斩击型Wizard，其准确的理由尚不明确，不过也许是选择了机体特性类似于GAT-x102尸装决斗（在第一次联合·PLANT大战时搭乘）的机体。
新锐机ZGMF-2000火虎实战配备后，伊扎克换乘到此机上。

这是专业的机动战士（MS）骑手（实质上是佣兵），同时也是作为MS收藏家而闻名的凯特.马蒂坎所拥有的专用机。
基础是ZGMF-1001扎古幻影，在两肩部的盾中内置了加特林炮，除了当作射击武器使用之外，还将盾本身作为手持的大型实体剑使用，转换成可以用于格斗战的独自装备。另外，腰部的侧裙甲前端是格斗战用的破甲者，在装甲基部内置有作为隐藏武器的手榴弹。
使用这样的复合兵装必需要相应的本事和熟练度，不过，搭乘者凯特似乎有喜欢使用这种武器类的倾向。另一方面，没有装备Wizard。机体上加入了表示凯特专用机的巨大白色十字涂装。

融合了ZGMF-X13A神意的能力和ZGMF-1000 扎古勇士的先进试作机。
ZGMF-X13A的龙骑兵需要先天的空间认识能力，但本机进行了改良，使一般的机师也能操作。
头部具有氘核光束的接收机构，搭载了基于核动力的混动发动机。GDU-X4小型龙骑兵的外形像剑刃，这是设想通过刺突和打击进行攻击的东西。但是，在本机发展型ZGMF-X666传说中，该用法被废除了。
本机被赋予了3000的型号，这意味着以后将承担主力机的一翼。但是，这个计划没有被实行。另外，本机得到的数据对ZGMF-X666的开发有很大的帮助。

近战特化的另一个主力量产机
与ZGMF-1000扎古勇士一样，是作为签订尤尼乌斯条约后的“新千年系列”的一环而开发的机体。原本是ZGMF-1000的竞争试作机，在综合性能方面有很多超过的部分，但主要是由于成本的问题而竞选败北。
不过随着第二次联合PLANT大战的激化，概念被重新评价，一转为制式采用。
成本高昂的因素之一是通过更换手臂和腿来确保多功能性的概念，重视对MS战的装备尤为显眼。射击用的火器类只有腕部的4连装光束枪。主武装是产生高周波脉冲的大型鞭“杀戮者鞭”、长刀身的风暴光束剑，擅长近战的白兵战。
另外，早早就采用了飞行单元，发挥接近AMF-101迪恩的飞行性能等，可以不分战场运用。
在战场上，作为先行试作机的海涅专用机被投入到战线，压倒了联合军和奥布的主力机等，表现出优异的性能。大战后半期与ZGMF-1000一起担任主力机的一翼。

M181SE 得罗普尼尔 4连装光束炮
装备在两前臂上的四连装光束炮。这是唯一的火器装备，虽然射程较短，但速射性能出色，在射程内拥有可以对舰战的威力。
MA-M757 杀戮者鞭
前臂上装备的鞭状打击武器。平时收纳在右腕部，使用时需要注意距离，但除了打击之外，它们还会缠绕在敌人身上产生高周波脉冲和电击，给机体和搭乘者带来伤害。产生高周波脉冲时发出红色光。
MMI-558 风暴光束剑
本机的近战用装备之一，在白刃战中发挥威力。是一把带有光束发生器的大型剑，一般收纳在盾牌里，使用时刀身伸长。

鲁道夫，出身于调整者中的资产家名门望族——维根斯坦家，是执着于美丽的人。这架机就是他的专用机
机体反映了鲁道夫的意向，全身涂成了金色。在扎夫特中，貌似允许机师自行决定使用个人颜色，但这个是他擅自弄的，据说是用真金去镀的。这在功能上完全没有意义不过是装饰而已，但是由于这个机体颜色，似乎让对峙的敌人误以为有ORB-01那特殊装甲的效果。（八咫镜）
实战中，当他在和蛇尾的MBF-P03third蓝异端三型交战中失去右腕之际，由于没有事前和鲁道夫打个招呼就用一般的ZGMF-2000进行修理，因此他对这件事感到很愤慨。

身穿白衣，由自己率领部队的伊扎克所搭乘的ZGMF-2000火虎。
型号中表示先行试作机的“X”也被拿掉了，表示机体规格等是量产机（生产型）。机体颜色以伊扎克的个人颜色——淡蓝色为基调进行了上色(给人的印象是蓝色变淡了)。
武装方面，装备了MMI-558风暴光束剑、MA-M757杀戮者鞭、M181SE德罗普尼尔四连装光束枪，和一般的ZGMF-2000是同型的东西(机体本身的内部零件的调整和定制等不明确)。
实战中，在蓝色宇宙盟主吉卜利路逃亡目的地的月球戴达罗斯基地侵攻作戦之后，伊扎克搭乘本机、率领玖尔队战斗直到战争结束为止。

赶到奥布困境的克莱因派秘密武器
ZGMF-XX09T大魔骑兵原本是新千禧年系列的选定竞赛机之一，是以ZGMF-X999A量産試作型扎古为基础开发的。由于种种缘故而落选。它的设计数据被超越了阵营的非战派组织终端机得到，在小行星带的秘密工厂“Factory”极秘制造，完成了共计3架。
这三架ZGMF-XX09T被委托给克莱因派，与三位王牌机师--希尔达、赫尔伯特和马兹一起于 "愤怒作战 "中参加了实战。直到“弥赛亚攻防战”为止，作为第二次联合PLANT大战后期的有效战斗力而活跃着。
可以说是本机特征的悬停移动的推进系统，颠覆了地上用MS的机动性的常识，不过这是选择骑手的东西。但是，3机并用防御领域——啸雨云的阵型战技“喷射气流攻击”显示了巨大的效果。另外，机体名称DOM是Dauntless Obliterator Magnificent的简称，是“壮大不屈的抹杀者”+TROOPER（骑兵）的意思。

JP536X 千兆发射器Multiplex
ZGMF-XX09T的主兵装。这是实体弹武器的大口径火箭筒和下部带有光束发射器的携行式连装炮。可根据情况区分使用实体弹或光束。原先设想与专用Wizard(骑士Wizard)联动，但终端机在获得设计数据改修时取消了和Wizard的连携。而且与原型相比，据说本体小型化了。

MX2351固相光 G14X31Z啸雨云
双腕部具有光束盾发生装置“固相光”。与ZGMF-X42S命运和ZGMF-X66传说的是同型号。左胸部的啸雨云是应用幻象粒子技术的攻性防御装置。在幕状的防御领域上可以实现对敌人造成伤害的“喷射气流攻击”。
EX-EZ1200 简易型Wizard
因为基础机是扎古系机体，所以采用了Wizard系统。但是克莱因派认为本来的Wizard难以运用，所以改为配备了2座推进器、安装了光束军刀的简易型。
MA-X848HD強化型光束军刀
近战用光束兵器。虽然光束军刀的规格是旧式的，但出力本身得到强化。因此，可以发挥与最新型同等以上的能力。平时安装在背部的简易Wizard上。
PS:加把劲咬咬牙超越金刚杵和超级蝎虎座不是梦

这种叫做钻枪的奇特兵器被分类为古怪的东西。因此克莱因派建造的大魔加了实用且最新锐的武装

在FACTORY制造的机体上，装备了搭载光束军刀的简易Wizard和光束盾发生器，综合力得到了强化。@lwq60227