科室主任和副主任之间矛盾不合的情况并不少见，这可能是由于职权、利益、意见分歧等各种原因引起的。如果矛盾激化，可能会对医院的工作产生负面影响，例如影响医疗质量、工作效率和医患关系等。因此，医院管理部门需要出面解决矛盾，并采取合适的措施保持科室稳定和医院的正常运转。有些医院会通过组织调整人员、明确各自的职责、加强沟通协调等方式来缓解矛盾。另外，科室主任和副主任也应该积极沟通，相互理解和支持，共同为医院的健康发展和医疗服务质量提升而努力。