微信小程序支付设置可以在微信公众平台的“设置”-“支付设置”中进行修改。具体步骤如下：1、登录微信公众平台，点击“设置”-“支付设置”，进入支付设置页面；2、点击“微信支付”，进入支付产品设置；3、勾选“小程序”，在本页面设置“微信小程序支付”；4、配置完毕后，点击提交，即完成小程序支付设置的修改。