低糖高活性干酵母和高糖高活性干酵母的主要区别在于糖分含量的不同。低糖干酵母中糖分含量较低，适合用于低糖或无糖的面包、蛋糕等食品的制作；而高糖干酵母中糖分含量较高，适合用于高糖食品的制作。此外，两者的活性也略有不同，需要根据具体的食品制作需求来选择使用。