PQQ较早是在细菌体内发现的，研究发现某些肠道菌群可以在肠道内合成PQQ并被人体利用，但这个数量很少，根本不能满足人体需要。土壤中的一些细菌也会产生PQQ，并存在于土壤中，如果被植物吸收就为植物利用。植物中也是有线粒体的，也需要能量代谢。

植物体内是含有PQQ的，而且我们人体的PQQ绝大多数都来源于食物，目前没有发现人体自身可以合成PQQ的证据。所以1989年PQQ被科学家认为是人体必需营养素。
日本科学家测定了26种常见食物中的PQQ含量，发现1克食物中PQQ的含量在3.65~61纳克不等。下面列举一些食物每1克含PQQ的纳克数，1纳克是十个亿分之一克。香蕉13、土豆17、胡罗卜17、菠菜22、乌龙茶28、绿茶30、豆腐30、猕猴桃27、欧芹35、纳豆61。纳豆是用大豆经过微生物长期发酵而来，是微生物不断分泌PQQ产生了浓缩效应导致纳豆PQQ含量相对较多。
美国研究人员检测发现，母亲乳汁中PQQ含量竟然高达每毫升140~180纳克。人类经过数百万年的长期进化，发展出了一套适应环境的高效运作机制，任何生理过程都有其必要性和合理性。母亲的乳汁中含有如此高浓度的PQQ，这说明该物质对新生婴幼儿的生长发育可能起到至关重要的作用。
在我国PQQ于2022年3月1日被批准为新资源食品，在国外已使用多年，建议每天补充量20毫克，这个数量相当于328公斤纳豆，相当于1.2吨土豆。所以多选择富含PQQ的食物还是很有必要的。