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关于DSSP计算氢键数量的疑问,求大佬解答

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如题,想问问如何通过DSSP得到蛋白质的氢键总数量?
由于dssp对于氢键的定义如下(当键能<-0.5kcal/mol定义为氢键):

Dssp文件格式如下:先给出各种氢键的totalnumber,再给出每个残基对应的键能

其中,N-H-->O的定义:

我的疑问:
统计方法1:统计了所有键能 < -0.5kcal/mol的键数量(右下角红色的4列键能)
统计方法2:将各种氢键的total number相加(左边蓝色列)
方法1、2答案不同,比如输入某pdb文件,方法1得到202个,方法2得到211个
不知道哪种统计方法更合理?
由于本人化学小白,实在没有相关知识,一头雾水。
求路过的大佬解答,感激不尽!QAQ


IP属地:上海1楼2024-04-07 18:31回复
    氢键不是根据距离来的么?这里怎么用的键能?


    IP属地:四川来自Android客户端2楼2024-04-07 20:19
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