字通密，号长春子，山东牟平人，生于南宋绍兴十八年戊辰正月十九日。于金世宗大定七年丁亥春在昆嵛山烟霞洞拜王重阳为师，时年19岁。 

　　金世宗大定十年正月，王重阳仙逝。邱处机同马丹阳、谭长真、刘长生4人背负师父骨骸送至咸阳埋葬后，在姜子牙钓鱼的磻溪自修7年后又去龙门修行。这期间他仅一蓑一笠，虽寒暑交替也不改变，世人呼他为“蓑衣先生”，在道学功德方面妙合虚无，理通玄奥，取得很大成绩。金世宗大定二十八年戊申（1188）春二月，皇帝闻其名，诏赴至阙，并奉旨于天长观主行万春醮事。之后世宗皇帝又多次召见，邱处机“部析天人之理，演明道德之宗，甚惬上意”，皇帝赐钱数万，邱处机上表辞之。 

　　金章宗元年邱处机回到山东，先后活动在栖霞昆嵛山、青州的云门山。公元1195年，全真七子同来崂山，弘扬全真教法，崂山所有的道士都接受了全真派理论，归依全真教派，崂山的各道教庙堂分别纳入全真七子的门派中。随后邱处机就在崂山各洞窟中修行，现留在崂山各处的邱处机遗迹就是在这个阶段形成的。 

　　元太祖十四年，成吉思汗和南宋皇帝所派的使者同日到达，邀聘邱处机前往。 

　　邱处机及同行的18位弟子远逾万里西行至大雪山，成吉思汗问及长生之药，邱对曰：“但有卫生之道，而无长生之药”。大汗爱其诚实，又问起统一天下之策时，邱处机对曰：“欲一天下者，必不嗜杀人。”遂建议成吉思汗“少杀戮，减嗜欲，敬天爱民”。大汗则尊他为“国师神仙”，赐虎符，付玺书，敕领全国道教。以铁甲军数千送还燕京，改天长观为长春宫，修白云观与宫为一体。 

　　元太祖二十一年邱处机逝于白云观，年79岁，殡于白云观的处顺堂。3年之后，启棺更衣时，但见其手足如棉，颜面如生，众弟子将遗骸营葬在长春宫东侧。在崂山上清宫前，有邱真人的衣冠冢。 

　　邱处机联系好学，除道学有成之外，精通文章、诗词和音律，所著道家内丹修炼的文章颇多，收入《磻溪集》、《鸣道集》；他率弟子西行，一路上所见所闻所感，均收入《长春真人西游记》。 

　　元世祖敕封他为“长春全德神化明应主教真君”。