义勇军：明确组织架构，不能就将军——民兵两个等级层次，有中间管理层和士官长之类职务，由他们负责带队完成马桶任务，同时他们会死会打完会消耗弹药等等，这需要玩家调配队伍规划资源，开放招兵、编制、税务协议和军火生产等管理协调给玩家，充分做出模拟经营的玩法，通过一系列关键任务让将军自己打下重要工厂或基地，然后再以经营系统让玩家充分利用自己打下的资源发展规划，给将军一个将军该有的实权和影响力而不是打黑工。
铁路：完全重制所有铁路据点包括本部，作为一个地下组织也是在兄弟会来之前联邦唯一一个明确敌对学院的组织，太弱了本部还不如我家厕所大，应当有庞大的地下网络和专门的情报战玩法，同时理念重改，揍学院的时候还会在不暴露的前提下顺手帮助居民，应当不只是招收愿意救合成人的，还要招单纯看学院不爽的。如果能把拯救合成人和学院挂钩就完美了（比如合成人也在组织干掉学院，于是有居民在铁路牵线下愿意与合成人并肩作战，或者居民被合成人替代时被铁路救下，义无反顾的也加入了铁路揍学院）
学院：处理好前因后果与目标冲突，从背景故事来看一开始是想当个避难所来运营顺带发展科技，那么很有可能学院也和避难所一样在最初抱有一个发展好了以后拯救米国的志愿，但是在某年某月某日学院被废土人狠狠的坑了或者迫害了，于是学院失望了黑化了不相信废土人能有文明了（参考电视剧里的废土***样）而只相信自己人，发誓要逆转人类的堕落，重新定义人类恢复战前文明，满怀热忱的研究越来越像的三合目的就是替代废土疯子来重启全人类，这样处理就更有血有肉而不是一群精神变态。同时对待联邦大聚落的态度也要更新，这帮科学家很明显是想当幕后黑爪之类的角色，那就让他们当，三合玩情报战心理战甚至让废土精神病自相残杀这不都是高效率吗。
兄弟会：明显问题就是兄弟会脑子一根筋，从头到尾都是我拳头大我有理都听我安排，无论是对非人类的看法还是对自己内部的看法还是对征税的看法，完完全全零情商零公关零宣发，导致为了居民死了一大批人联邦还不领情，兄弟会的实力不怎么需要改了（但飞艇得俩不然5炮就家没了太幽默了）主要是形式，最好是像76钢铁黎明那样改，兄弟会它不是单纯的哑巴，它会去和居民宣传招兵，居民会有小迷弟，会得罪联邦的一些势力，会与铁路义勇军存在互动博弈而不是你咬我我就咬你，也不会蠢到让铁路五个人乐呵呵的旅个游就炸没了，而是铁路需要各种情报和特工组一点点对抗，兄弟会内部思想也可以出现分歧，就比如丹斯这是个三合，丹斯很明显对同事相当好，不是说麦克森一句全兄弟会都要他死就真的所有人都要他死，应该有议论以及为了稳住军心麦克森和老冰棍需要做的事等等。同时与义勇军很明显的可以存在合作关系，义勇军要和兄弟会合作到什么程度取决于老冰棍，老冰棍也可以凭借为兄弟会做的事去与兄弟会谈判，为敌是不太可能的毕竟人家T60人海还没过来呢惹不起
抢手：有麦奎迪的事就没啥可说的，老老实实做一个大反派得了，但是可以被主角雇佣（前提是没有做义勇军情况下）做了义勇军就匿名雇佣，可以接受赏金任务，可以为聚落做保护委托，同时主角想拉过来加入义勇军也需要说服聚落放弃枪手。
掠夺者：联邦那么大，掠夺者就那几个？？战斗力完全靠出生点？？都搞成掠夺者营地！全是掠夺者聚落，各个头目组织关系都有不同，比如贾里德和高塔汤姆敌对什么什么，主角可以选择加入其中比较大的一些头目，然后黑吃黑吃个痛快，爽玩黑涩会剧情，亦或是义勇军和铁路合作，铁路派特工搞情报帮助主角干翻大头目，这样也能给铁路洗刷动保罪名两全其美。
结局之后，联邦怎么办？是义勇军就重建CQC开个议会吧，是兄弟会就立规矩去交涉吧，是学院那就狠狠替换重做人类吧，按阵营思路是这样但主角可以凭自己的影响力协商谈判，两两联合或三联合四联合，对学院怎么处理是炸了还是保留但严加看管，科技怎么划分给义勇军还是兄弟会，三合安置怎么办，这都需要玩家来善后拍板，真正领导整个联邦前往更美好的未来。