舞台はジルクスタンによるゼロとナナリー誘拐事件『ハシュベスの戸惑い』を経た時代。世界は平和へと生まれ変わったかに見えた。しかし、いまだ争いは絶えず、キルギスでも政府軍と市民の間で大規模な武力衝突に発展していた。時に光和4年……。新たなるナイトメアフレームが世界の平和を切り裂く！