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ChIP-seq是什么?

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🔍 ChIP-seq是什么?
ChIP-seq全称:染色质免疫沉淀测序(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)
本质:锁定特定蛋白(如转录因子、组蛋白修饰酶)在基因组上的结合位点!
🔬 实验三步走
Step1:交联抓包 💥 → 甲醛处理细胞,把DNA和蛋白“粘”在一起
Step2:抗体钓鱼 🎣 → 用特异性抗体抓住目标蛋白,连带结合的DNA片段一起沉淀(一锅端!)
Step3:测序破案 🧬 → 纯化DNA,高通量测序+生物信息学分析,锁定结合位点(精确到碱基!)
🌟 三大应用场景
1️⃣ 转录因子地图:找到调控基因的“开关大王”(如p53、NF-κB的结合位点)
2️⃣ 表观遗传解密:追踪组蛋白修饰(H3K4me3激活标记、H3K27me3抑制标记)
3️⃣ 疾病机制挖掘:癌症中癌蛋白异常结合、自身免疫病相关调控元件定位
💡 为什么选ChIP-seq?
✅ 高分辨率:精确到单碱基水平(比ChIP-chip更精准!)
✅ 全基因组覆盖:无预设目标,全网筛查DNA-蛋白互动
✅ 动态监测:比较不同处理/疾病状态下的结合差异
🚀 进阶玩法
🔹 CUT&Tag:低样本量、高信噪比升级版!
🔹 多组学联用:ChIP-seq + RNA-seq = 因果调控网络全解析
广州基云在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域,具有丰富的经验,助力互作机制研究。
如有相关科研问题,欢迎留言探讨。


IP属地:广东1楼2025-03-28 09:03回复