生物信息吧
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各类生物信息问题讨论与交流

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    在Western Blotting实验中,将目标蛋白高效地从凝胶转移至印迹膜上,是实验成功的关键一环。这一过程需要根据样品特性和目标蛋白的性质进行细致优化。以下是我们精心总结的六大策略,旨在帮助你提高WB转印效率。 1. 精选转印方式 首先,需根据实验需求选择最适合的转印方式。湿转,适用于广泛分子量范围的蛋白转印,膜与胶完全浸没在转印缓冲液中。半干转,则更适用于30-120kD范围内的蛋白,且转印速度更快,缓冲液仅覆盖膜与滤纸。而快速半
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    在生物医学研究中,蛋白质是生命活动的关键角色,而抗体作为能够精准识别并结合特定蛋白质的分子,其重要性自不待言。然而,即便针对同一抗原的抗体,在不同生产厂商或应用于不同样本类型时,所检测出的蛋白质分子量往往会出现令人困惑的显著差异。这一现象不仅给研究者带来了诸多困扰,也对实验结果的阐释和应用造成了深远的影响。本文将深入剖析这一现象背后的缘由,以及它对我们理解和运用抗体所带来的挑战。 抗体是由免疫系统
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    大佬们,老师布置了一个任务,让查询甲基苯丙胺在人体内的代谢途径,在什么酶的作用下转化成了什么,直到进入TCA,但是我用KEGG,PubMed,metaboanalyst等等都查不到怎么办呀,是我的思路有问题吗?
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    番红固绿染色是一种常用的植物组织染色技术,通过利用染料分子对细胞内不同成分的亲和性差异,实现对特定结构的选择性着色,从而增强细胞结构的可视化效果。以下是关于番红固绿染色实验操作的一些小细节和注意事项。 一、实验原理 番红固绿染色主要基于染料分子与细胞内特定成分的相互作用。番红能够与植物细胞壁中的木质素、纤维素等多糖发生作用,形成鲜明的颜色对比;而固绿则常用于染色含有浆质的纤维素细胞组织,使细胞结构更
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    有没有老师指导一下,做western blot电泳时,条带压不成一条直线,是散的,而且越往下跑颜色越淡,是因为什么情况呀#Western blot#
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    本人211在读研二 已经通过自学完成一篇一区sci 致力于生信多组学分析 主要是通过宏基因组和转录组联合分析研究肠道微生物与宿主相互作用我这边有很多资料 可以一起学习哟#生信##生物信息##R语言##多组学##生信分析#
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    一、实验原理 细胞划痕实验通过在单层贴壁细胞培养中制造人为的划痕,然后观察细胞如何向划痕区域迁移并修复损伤,从而评估细胞的迁移能力。这种方法常用于研究细胞迁移的调控机制,以及药物或其他处理因素对细胞迁移的影响。 二、应用简介 细胞迁移在多种生理和病理过程中发挥重要作用,包括免疫反应、激酶过程、肿瘤迁移、组织损伤修复和细胞生长等。细胞划痕实验作为一种简单而有效的评估方法,被广泛应用于这些领域的研究。 三
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    做转录组,蛋白组,代谢组,16 S及联合分析PCA分析,差异分析(火山图、热图、雷达图),功能分析(KEGG、GO和GSEA分析),联合分析网络图 个性化分析:根据个人研究需求挑选差异基因/蛋白/代谢物做热图,挑选想要的通路做KEGG气泡图。有需要可丝我,诚信接单,态度友好,分析认真。
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    C57小鼠的由来 C57BL作为小鼠品系中广泛应用的代表,其名称中的BL源自英文Black,意指该品系小鼠以黑色外观显著区别于其他品系。 C57BL涵盖多个科研常用的亚系,如C57L、C57BL/6、C57BL/10,其中C57BL/6尤为普遍,这些小鼠常被简称为黑鼠或黑色小鼠。但需注意的是,此类称呼易引起混淆:提及实验用黑小鼠时,虽常指C57BL/6,却非绝对。 另外,C57BL/6亚系内还包含多种基因型小鼠,其命名习惯是在6后附加字母,例如C57BL/6J、C57BL/6N,因此仅凭黑色外观无法确
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    #01碘-碘化钾(I2-KI)溶液 碘-碘化钾(I2-KI)溶液,作为植物组织化学测定的关键试剂,能有效将淀粉染成蓝紫色,蛋白质呈现黄色。 配制方法:取碘化钾2g,先溶解于少量蒸馏水中,完全溶解后加入碘1g,充分振荡至溶解,稀释至300ml蒸馏水,储存于棕色玻璃瓶中。使用时,建议稀释2至10倍,以避免染色过深,确保染色效果更为理想。 #02苏丹Ⅲ染色剂 苏丹Ⅲ(SudanⅢ或Ⅳ)染色剂,能够显著将木栓化、角质化的细胞壁以及脂肪、挥发油、树脂等成分染
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    了解线粒体自噬及其调控机制MDL科研助手 2024年12月13日 17:42 河北01线粒体自噬 线粒体自噬(mitophagy)是2018年公布的生物物理学名词。 线粒体自噬的定义是选择性地隔离和降解受损伤或不完整线粒体的自噬方式。参与维持线粒体网络功能的完整性和细胞的稳态。 线粒体自噬主要包括四个过程: 1、识别:当线粒体受到损伤或其功能下降时,细胞能够识别这些变化并标记这些线粒体以供降解。这种识别可以由多种信号途径介导,比如PTEN诱导的拟激酶1(PIN
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    一、荧光原位杂交技术原理 荧光原位杂交技术是根据核酸碱基互补配对原理,用半抗原标记DNA或者RNA探针与经过变性的单链核酸序列互补配对,通过带有荧光基团的抗体去识别半抗原进行检测,或者用荧光基团对探针进行直接标记并与目标序列结合,最后利用荧光显微镜直接观察目标序列在细胞核、染色体或切片组织中的分布情况[1]。 原位杂交技术最早由Pardue和Gall、John于1969年建立[2],他们将放射性标记的 DNA与目标DNA接合,通过放射自显影
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    根据国家自然科学基金委员会官网通知,预计2025年度国家自然科学基金项目指南将于2025年1月中旬正式发布,您准备好了吗? 2025年有哪些变化? 一、能同时申报两个本子 作为高级职称科研人员,如果在某一年里没有主持任何项目,可以采取“双重投递”策略。具体来说,就是在同年内同时向不同学部投递项目申请。同一研究课题在不同学部的评审中可能会获得不同的评价。这样可以有效分散风险,提高项目中标的概率。 值得注意的是,国家自然科
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    紫外辐射(UV)作为一种普遍且高效的消毒手段,其原理在于能摧毁微生物的DNA结构,从而达到杀菌效果。然而,对于已灌装至容器内的细胞培养液而言,紫外线的照射可能会对其内含的蛋白质及其他易受影响的成分带来伤害,特别是当照射时间延长时。举例来说,B族维生素群及色氨酸在紫外线的照射下可能发生化学变化,进而丧失其原有功能。 由于紫外线的穿透力相对有限,普通玻璃材质与塑料能有效阻挡紫外线,因此,存放于离心管或其他容器
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    细胞转染(Transfection),是将外源性基因导入细胞内的一种专门技术。随着基因与蛋白功能研究的深入,转染目前已成为实验室工作中经常涉及的基本方法。目前常用的转染方式是脂质体转染法。 原理 脂质体作为体内和体外输送载体的工具,已经研究的十分广泛,中性脂质体是利用脂质膜包裹DNA,借助脂质膜将DNA导入细胞膜内。带正电的阳离子脂质体,DNA并没有预先包埋在脂质体中,而是带负电的DNA自动结合到带正电的脂质体上,形成DNA-阳离子脂质
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    活体成像技术是在生物体存活状态下,运用影像学手段对生物过程实施组织、细胞及分子层面的定性与定量分析的科学方法。该技术涵盖生物发光(bioluminescence)、荧光(fluorescence)、同位素成像(isotopes imaging)以及X光成像(X-ray imaging)等多种方式。具体而言,生物发光利用荧光素酶基因对细胞进行标记;荧光技术则通过荧光报告基团所表达的荧光蛋白,如GFP、EGFP、RFP、YFP,以及荧光染料等进行标记,随后借助专业仪器进行检测分析。 02标记原理 ①实验
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    流式细胞术 (Flow Cytometry, FCM) 是一种在液流中快速检测细胞特性的技术。它通过将单个细胞与特异性抗体结合,对细胞进行多参数定量分析,包括细胞表面标记、细胞内蛋白质表达、细胞周期、DNA含量等。流式细胞术具有高通量、高灵敏度、高特异性等优点,广泛应用于免疫学、血液学、肿瘤学等领域。 流式细胞术的工作原理 在流式细胞仪中,细胞被包裹在鞘液 (sheath) 中,通过喷嘴以一定的速度射出。当细胞依次通过激光束时,激光束会照射到细胞
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    生信分析生信医学医学sci指导答疑代做生信医学sci文章指导写作生信分析指导复现,生信分析,医学sci、医学综述、文章,选题,框架,创新,投稿,期刊,推荐等,JCR、中科院及中文核心。医学三维重建、医学图像处理、医学图像分割、医学语义分割、医学目标检测、生物信息学。孟德尔随机化、SCI、基础医学、医学建模、医学fang真、医学影像、转录组、单细胞。宏基因、代谢组、群体遗传、医学统计、药理学、ct重建、医学结构fang真、生信扩增
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    单细胞分析 tcga数据分析 多组学分析 单细胞数据分析 TCGA,GEO,等公共数据库常规分析 擅长以下数据分析:RNA-seq、SCRNA-seq等高通量测序数据;整合 GWAS数据和 eQTL,如SMR,TWAS, Sherlock等;GWAS相关分析LDSC, GCTA, GSMR, TwoSampleMR,conjFDR、Mixer 等 疾病相关细胞类型的LDSC与MAGMA分析;SCRNA-seq与 sCATAC-seq数据的整合分析,如SCENT分析、SCARlink分析等基因表达,CNV,甲基化,突变等差异基因分析,KEGG/GO/GSEA功能富集,单细胞分析,孟德尔随机化,生存分析,WGCNA,聚类
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    质粒(plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,为双链闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。质粒作为低等生物体内的最小遗传单位,具有分子量小、复制速度快等诸多优点,是分子生物学实验中不可缺少的工具载体。 01点突变 点突变指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目的DNA片段(可以是基因组,也可以是质粒)中引入所需变化(通常是表征有利方向的变化),包括碱基的添加、删除、点突变等。定点突变能迅速、高效的
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    一、污染防控措施 在执行PCR操作时,操作人员需严格遵循既定规程,以最大化减少乃至消除PCR过程中的污染风险。 01 操作区域划分: 尽管当前常规PCR操作难以实现全程单人单管的完全封闭作业,但无论条件如何,均须确保实验在三个独立区域内分阶段完成,且PCR的前处理与后处理需严格隔离: 样本制备区:专用于扩增模板的准备工作; PCR扩增区:涵盖反应体系的配制及PCR扩增过程; 产物分析区:负责凝胶电泳分析、产物成像及重组克隆的操作。
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    目前,无论是在国内还是全球范围内,实验动物中数量最多、应用最广泛的当属聪明、活跃且敏感的老鼠。数据显示,每年有超过2000万只动物被用于生物医学研究,其中超过90%为老鼠及其他啮齿类动物。大、小鼠成为实验首选,主要归因于以下四点: 第一,鼠类与人类基因相似度高达80%以上,每十只实验动物中约有九只是小鼠或大鼠。小鼠特别适合人类遗传病研究,而大鼠则在癌症研究与毒理学实验中表现出色。研究显示,老鼠与人类骨骼结构有99%
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    一、磷酸化蛋白WB怎么跑? Western Blot作为检测蛋白质磷酸化状态的重要手段,其操作流程与非磷酸化蛋白检测相似,但磷酸化蛋白因含量稀少且易失修饰,检测难度增加。失败原因多样,包括封闭不当、抗体选择失误或样本中磷酸化蛋白含量过低。以下要点助力磷酸化蛋白实验成功。 二、磷酸化蛋白表达量评估 蛋白磷酸化受多种刺激影响,需结合文献、预实验及PhosphoSitePlus数据库,综合确定表达水平。 三、WB检测磷酸化蛋白关键点 01 样本处理优化
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    Co-IP全称Co-Immunoprecipitation,中文学名免疫共沉淀,是一种以抗体和抗原识别专一性为基础,用于研究蛋白质之间相互作用的经典方法。 实验流程样本制备 细胞样本:收获细胞,加入适量细胞裂解缓冲液和蛋白酶抑制剂冰上裂解,超声破碎,离心取上清。 组织样本:剪碎组织,按组织量加入裂解液和蛋白酶抑制剂,匀浆器匀浆,直至充分裂解,离心取上清。 细胞裂解 物预清除 (选做) 向制备好的裂解物中分别加入一定量的protein A和protein G,4℃旋转孵
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    Co-IP全称Co-Immunoprecipitation,中文学名免疫共沉淀,是一种以抗体和抗原识别专一性为基础,用于研究蛋白质之间相互作用的经典方法。 实验流程样本制备 细胞样本:收获细胞,加入适量细胞裂解缓冲液和蛋白酶抑制剂冰上裂解,超声破碎,离心取上清。 组织样本:剪碎组织,按组织量加入裂解液和蛋白酶抑制剂,匀浆器匀浆,直至充分裂解,离心取上清。 细胞裂解物预清除 (选做) 向制备好的裂解物中分别加入一定量的protein A和protein G,4℃旋转孵育
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    第二期课程内容: 1.宏基因组研究专题,包括宏基因组简介、建库测序、分析环境搭建、物种分类原理、centrifuge安装、数据库、三代测序宏基因组物种分类鉴定等。 2.基因表达调控研究专题,涉及RNAseq简介、原理、建库方法、不同测序平台比较、定量方法、分析环境搭建、数据质控过滤、比对、计数、可变剪切检测、基因融合检测等。 3.基因组研究专题,包括基因组拼接原理、kmer估计基因组大小、二代测序拼接算法、fasta格式文件介绍与处理、quast评
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    小鼠尾静脉注射技巧: 1. 将小鼠固定好,将尾巴拉直,绷紧,这是成功的第一步。 小鼠性情较温顺,一般不会咬人,比较轻易抓取固定。通常用右手提起小鼠尾巴将其放在鼠笼盖或其它粗糙表面上,在小鼠向前挣扎爬行时,用左手拇指和食指捏住其双耳及颈部皮肤,将小鼠置于左手掌心、无名指和小指夹其背部皮肤和尾部,即可将小鼠完全固定。 在一些非凡的实验中,如进行尾静脉注射时,可使用非凡的固定装置进行固定,如尾静脉注射架或粗的玻璃
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    想把GWAS和BSA的图画到一起,各位牢大有没有知道怎么实现的。
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    医学sci科研指导个人发表多篇SCI,提供sci指导,生信分析,指导思路,指导返修,增加创新点。接医学科研sci核心全程1v1指导临床,基础,公卫,护理,药学等均可个性化设计课程,根据你提供的资料,学术背景和目标期刊,进行1v1全程指导。内容包括:1.研究方案设计技巧2.研究执行和统计分析3.写作技巧指导和无限次数修改服务4.英文翻译服务5.投稿指导服务6.SCI生信分析 医学相关生信思路➕课题实验设计硕博科研计划书、研究生课题计划书等#覆盖医
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    目前,无论是在国内还是全球范围内,实验动物中数量最多、应用最广泛的当属聪明、活跃且敏感的老鼠。数据显示,每年有超过2000万只动物被用于生物医学研究,其中超过90%为老鼠及其他啮齿类动物。大、小鼠成为实验首选,主要归因于以下四点: 第一,鼠类与人类基因相似度高达80%以上,每十只实验动物中约有九只是小鼠或大鼠。小鼠特别适合人类遗传病研究,而大鼠则在癌症研究与毒理学实验中表现出色。研究显示,老鼠与人类骨骼结构有99%
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    生信分析代做 医学sci文章指导指导二区三区+sci多篇10+主研方向医学类,擅长生信分析,NHANES数据分析,医学sci数篇发表经验,语言图表修改,提供建议。主研方向癌症、心血管、肥胖、糖尿病,擅长机制绘图、Meta分析,医学sci数篇发表经验,可语言图表修改,提供建议。sci投稿指导。长期从事科研工作,一区sci多篇,二区三区+sci多篇10+,多个期刊的审稿专家,具有丰富的审稿经验,处理修改意见和回复的经验和技巧。心血管学,肾病学,肿瘤学,
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    痛风是一种由体内血清尿酸浓度持续升高引起的晶体沉积性慢性疾病,其特征是单钠尿酸盐(MSU)结晶沉积在关节和非关节结构中。动物模型对于深入研究痛风的发病机理和开发新的治疗方法具有重要意义。痛风动物模型是研究痛风发病机制和测试新治疗方法的重要工具。这些模型试图模仿人类痛风的病理生理特征,包括高尿酸血症、急性关节炎发作以及痛风石的形成。 常见的痛风动物模型 大鼠模型:大鼠是最常用的痛风动物模型之一,可以通过注
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    在细胞培养的世界里,有一种“李鬼”现象,即一些细胞系可能因为交叉污染、误传或标记错误,而失去了它们原本的“李逵”身份。这些“李鬼”细胞不仅会误导我们的实验结果,还可能损害我们科研工作的信誉。因此,在我们开始任何实验之前,进行细胞STR鉴定是必不可少的步骤。一、什么是STR鉴定STR(Short Tandem Repeats,短串联重复序列)鉴定是一种基于分子生物学的遗传分析技术,用于检测个体DNA中的特定重复序列。这些序列由短的、连续重复

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