神威时代最主要的人物是塞菲隆之民的守护人神威，此外还算是瓦吉那欧的徒弟，他同时也是第五章的主角，神威时代的故事基本都是由他的视角见证的。神威时代故事的最后，神威因为掩护幸存的塞菲隆之民撤退而战死，死后被神树的力量炼成不灭的幻影兵，在数十年后的圣石时代苏醒过来。
缇奥娜是神威时代暴食国的一名角斗士，后来与神威结识，算是神威时代剧情的一个重要人物，某种意义上来说也算是女主。最后在掩护塞菲隆之民幸存者撤退的战斗中，缇奥娜因为替神威挡了克里克迪斯的一剑而死亡。缇奥娜的个人剧情显示她认识拉米亚，这段故事应该发生在认识神威之前。
拉米亚是神威时代愤怒国的战场之花，游戏里曾经多次提到拉米亚在愤怒国和暴食国的战争“千日之夜”中大活跃，这场战争目前并没有与之相关的大剧情，应该是发生在神威死了之后。拉米亚的主要人际关系是，她是神威时代愤怒国另一个战场之花特蕾莎的徒弟。此外她也认识嫉妒国的骑士普莉希拉。根据念装暗示，在千日之夜发生以前，特蕾莎应该已经死于普莉希拉手上。

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普莉希拉是神威时代嫉妒国的骑士，和特蕾莎是宿敌，并且初次遇到特蕾莎之前就已经认识拉米亚。在神威时代，愤怒国和嫉妒国正处于战争之中，虽然这两个国家之间基本上就没有不打仗的时候。
夏姆是神威剧情中另一个重要人物，在神威时代他还是个少年，被神威救下并且带回了村中，塞菲隆之民灭族以后和大部分幸存者一起逃亡沙漠。
玛尔塔和伊西德是第五章的剧情人物，基本上，玛尔塔扮演了类似于第一章中阿加莎的角色，而伊西德扮演了类似迪奥斯的角色

圣石时代
时间线上圣石时代是神威时代的数十年后，主线时期的100—200年前。圣石时代也是游戏里剧情量最多的时代，最主要的剧情是圣石的追忆，巴贝尔战记除了五章下篇以外都发生在圣石时代，此外还有若干活动剧情和个人剧情。
圣石的追忆剧情的源头是贪婪国灭亡绵津见。瓦吉那欧找到了贪婪国的狮子王，告诉他他是尼姆尔的转世容器，尼姆尔转世必定会打破世界力量平衡并且统治世界。而艾梅尔转世会阻止尼姆尔转世，并且艾梅尔的转世容器是绵津见的女王。于是狮子王灭亡了绵津见并且屠杀了绵津见王族。在绵津见灭亡的时候，圣教骑士团第四团副团长库达恩修坦（魔枪）正在绵津见修行，他拼死救下了绵津见公主神乐，同时顺手救了夕凪和风早姐弟，后来风早为了报恩加入了圣教骑士团。绵津见事件给魔枪留下了阴影，他从此沉迷暗之力，变成了一个睿智。

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绵津见灭亡以后，唯一幸存的公主神乐被魔枪带去了圣教骑士团，巫女千早成了绵津见最有声望的人物，贵族出身的武士斩月想要依靠自己的力量重新统一绵津见，并且脑回路清奇地视千早为自己的阻碍，而另一个武士贵族铃鹿是斩月的死对头，一心想打败斩月。巴贝尔战记第四章里提到过，绵津见最早是为了封印鬼而建立的国家，当时参与封印鬼的三大家族就是后来的王族，笼紫家族和黑斗家族。笼紫家族在绵津见灭亡以前应该就已经遭重了。

当时的家主有侧室生的儿子阵和正室生的女儿黄泉两个子女，他打算让兄妹骨科，但是被阵拒绝，随后又打算傾举族之力雷普黄泉，黄泉暴走杀死全族，阵主动背锅，随后两人都离开绵津见展开了猫鼠游戏。阵曾经和沙漠商人阿基尔一起回到绵津见，斩月还试图招揽他作为部下，黄泉后来也找到了阿基尔询问阵的去向。
笼紫家族有一个盟友柴闪光家族，在绵津见事件中，柴闪光家族损失惨重，只剩下最后的传人黎明，黎明后来成为了一名杀手。因为剑术风格偏阴险，柴闪光家族在绵津见是很受鄙视的存在，连分家双闪光家族都看不上他们。双闪光家族的传人克雷特根据念装暗示应该是在和黎明的决斗中被杀了。只有千早并不鄙视黎明，黎明因此喜欢上了千早。在黎明当杀手期间，他曾经救过贪婪国的杀手菲林，菲林也因此喜欢上他，不过并没有下文。

黑斗家族情况目前并没有具体说明，出场人物只有莲一个人，莲还有个没有露脸的姐姐并且莲很畏惧她。
莲第一次出场时是一个杀手，接受了刺杀绯炎骑士团团长的委托，结果反被击败，因此加入了绯炎骑士团。后来又被绯炎骑士团派到影之梅萨亚成为卧底。

巴贝尔战记的几个章节里，第二章算是圣石前传，所有剧情都发生在圣石之前，第一章算是半个前传，一半剧情是前传，一半平行，第四章是后传，第三第五章是外传，除了都是同一个时代的故事以外交集不多

暴食国剧情就是
1.有一位老人，在一次国内暴动之后迅速上位成为统治者
2.这位老人十分长寿，通过汲取年轻人的生命来延续自己的寿命
3.这位老人虽然现在表面上退位了，但是实际上只是在垂帘听政

巴贝尔战记第二章是扎哈尔的故事，第二章一开始是他的少年时代，扎哈尔是人类和精灵的混血，寿命理论上来说应该比一般人类要长，所以这时候的年代可能很早。由于混血的身份，再加上他天生就有强烈的破坏欲，因此他很不受其他精灵的待见。某次扎哈尔暴走干掉了一个舅舅，随后被软禁起来，由一个黑暗精灵女仆蕾迪亚负责照顾他。
黑暗精灵应该是精灵的一个分支，不过双方的关系很差，蕾迪亚貌似就是在精灵和黑暗精灵的战争中被俘虏的。蕾迪亚和扎哈尔一起逃离了精灵社会来到愤怒国。在扎哈尔逃走以后，这一支精灵很快因为不明原因而灭亡